Sesuai dengan fungsinya perpustakaan merupakan pusat informasi yang sangat berpengaruh bagi peningkatan kualitas Pendidikan. Pada kenyataanya hampir di semua Lembaga Pendidikan sekolah yang memiliki kualitas baik, memiliki perpustakaan yang baik pula. Oleh sebab itu, kualitas Lembaga Pendidikan sangat tergantung kepada kualitas perpustakaannya. Awalnya, pada tahun 1983 perpustakaan MAN 1 Pati berdiri bersamaan dengan berdirinya MAN 1 Pati, dengan Alamat di Jl. Wahid Hasyim pati. Berhubungan dengan itu  jumlah siswa selalu bertambah setiap tahunnya, maka pada tahun 1985 MAN 1 Pati berpindah tempat ke REndole, Muktiharjo (sekarang jl. Pratomo). Kemudian pada tahun 2003 MAN 1 Pati pindah lagi ke Jl. Panglima Sudirman km.3 Margorejo Pati sampai sekarang.

Saat ini perpustakaan kami masih terus berbenah untuk menyesuaikan perkembangan zaman, mulai dari mengganti sistem sirkulasi peminjaman dari tradisional menjadi modern dan pengadaan buku-buku baru. Luas perpustakaan di MAN 1 Pati ini sudah mencapai 144m² dengan rincian bangunan, Panjang 18m dan lebar 8m. Jumlah koleksi buku yang berada di perpustakaan juga sudah termasuk banyak mulai dari buku novel, buku tentang Sejarah, buku tentang pemngembangan diri dll. Jumlah totalnya yaitu 1504 eksemplar. Selain itu juga pada tanggal 1 April 2022 Perpustakaan MAN 1 Pati juga telah mendapatkan penghargaan karena telah mengikuti akreditasi relaksasi yang diadakan oleh perpustakaan daerah Pati. Untuk kedepannya perpustakaan MAN 1 Pati ini akan selalu berbenah agar dapat mengikuti akreditasi perpustakaan yang lainnya.

Perpustakaan MAN 1 Pati juga telah memiliki NPP (Nomor Pokok Perpustakaan) yang menandakan bahwa perpustakaan ini telah terdaftar dan tercatat di perpustakaan nasional. Bersamaan itu MAN 1 Pati memberi nama perpustakaannya dengan dengan nama perpustakaan ‘’Widya Pustaka” dengan makna Widya berarti ilmu pengetahuan dan Pustakan berarti buku atau sumber, maka jika digabungkan Widya Pustaka adalah sumber ilmu pengetahuan. Dengan nama tersebut diharapkan perpustakaan MAN 1 Pati dapat menjadi sumber ilmu pengetahuan bagi Masyarakat sekitarnya mulai dari siswa-siswanya sampai bapak dan ibu guru.